Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms