Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME2A4GXA9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms