Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms