Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYQ6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYQ6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYQ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYQ6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYQ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms