Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms