Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms