Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LEMD3Q9Y2U8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms