Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms