Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4Q9UP95 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms