Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms