Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms