Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms