Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms