Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ9

PGAP2, Post-GPI attachment to proteins factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP2Q9UHJ9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP2Q9UHJ9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP2Q9UHJ9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms