Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS29Q9UBQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS29Q9UBQ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS29Q9UBQ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS29Q9UBQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS29Q9UBQ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VPS29Q9UBQ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VPS29Q9UBQ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VPS29Q9UBQ0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms