Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms