Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms