Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms