Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIPA1L2Q9P2F8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIPA1L2Q9P2F8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms