Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms