Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms