Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD2Q9NZR1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD2Q9NZR1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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