Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms