Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CD163L1Q9NR16 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms