Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM7Q9NR12 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms