Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPHNQ9NQX3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPHNQ9NQX3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms