Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms