Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms