Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms