Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms