Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD3Q9H7B4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD3Q9H7B4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms