Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms