Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms