Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF541Q9H0D2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms