Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms