Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPCDR1Q9BY65 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms