Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC8Q9BY41 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms