Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms