Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms