Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms