Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms