Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms