Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACCSQ96QU6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms