Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms