Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG8Q96MW5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms