Protein–RNA interactions for Protein: Q96L14

CEP170P1, Cep170-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170P1Q96L14 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP170P1Q96L14 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP170P1Q96L14 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP170P1Q96L14 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP170P1Q96L14 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP170P1Q96L14 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP170P1Q96L14 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP170P1Q96L14 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP170P1Q96L14 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP170P1Q96L14 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms