Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms