Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms