Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TOPBP1Q92547 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms