Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CTTNBP2Q8WZ74 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CTTNBP2Q8WZ74 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms